You searched for: Biochemistry Learning Activities

Supplier: G-Biosciences

Denna laboration är utformad för att demonstrera de olika klasserna av proteinmolekyler och deras klassindelning grundad på löslighet. Eleverna lär sig fraktionering av lösliga, olösliga membranproteiner och cytoskelettproteiner från ett vävnadsprov. Den olösliga proteinfraktionen fraktioneras ytterligare till hydrofila och hydrofoba membranproteiner. Cellmembranstruktur och rollen för hydrofoba membranproteiner tas upp. Denna laboration ger även en möjlighet att förstå egenskaperna hos olika klasser av detergenter och rollen för detergenter vid lösliggörning av hydrofoba membranproteiner.

Supplier: G-Biosciences

Laborationen fysikaliska egenskaperna hos proteiner är en laboration för att undersöka de fysikaliska egenskaperna hos olika proteiner. Eleverna kommer att lära sig om proteinlöslighet och hur lösligheten påverkas av temperatur, pH, salt och dielektrisk konstant. Laborationen ger kunskap om proteinutfällning, denaturering på grund av pH förändring, hög salthalt, organiska lösningsmedel och proteindenaturering som ett resultat av hög temperatur. Dessutom kommer satsen att demonstrera hur ämnen som inte är proteiner, såsom detergenter, drastiskt förändrar proteinmolekylers fysikaliska egenskaper och som ett resultat, att förstå betydelsen av detergenter inom proteinsolubilisering. Denna laboration innehåller analys av tre olika sorters rena proteiner. Efter tillsats av detergent undersöks på nytt proteinernas fysikaliska egenskaper. Eleverna utmanas att tänka över hur fysikaliska egenskaper hos proteinmolekyler kan användas för rening och karaktärisering av proteiner och tillämpar därefter sina slutsatser på ett försöksprov med ett komplext vävnadsextrakt.

Supplier: EDVOTEK

I detta enkla och säkra experiment får eleverna lära sig om enzymkatalys, enzymfunktionalitet och sambanden mellan proteiners struktur och funktion. Eleverna får utföra en enzymanalys och fastställa den enzymatiska reaktionshastigheten.

Supplier: EDVOTEK

Isolation of high molecular weight chromosomal DNA is the first step in molecular cloning since it is the source of genes in cells. This experiment provides DNA extraction LyphoCells and reagents for isolating chromosomal DNA from E. coli. After spooling from solution, the DNA can be dissolved and analysed by agarose gel electrophoresis as an optional lab extension activity.

Supplier: EDVOTEK

Investigate how agarose gel electrophoresis unlocks the color code used by food scientists to make colorful candies.

Supplier: EDVOTEK

Milk proteins are the most common food allergens in children. Accurate detection and labeling is vital to inform consumers about potentially dangerous foods.

Supplier: EDVOTEK

I det här experimentet får studenterna rena restriktionsenzymet Eco RI. Det ingår ett jonbyteskromatografisteg för Eco RI-rening. Kolonnfraktionerna testas för enzymet med lambda-DNA och klyvningsprodukterna identifieras med gelelektrofores. Fraktionerna som innehåller Eco RI identifieras och slås samman. De totala och specifika aktiviteterna beräknas. Rekommenderas för avancerade kurser.

Supplier: EDVOTEK

Småskalig snabbisolering av plasmid-DNA är en rutinmetod som används vid screening och analys av rekombinant DNA i klonings- och subkloningsexperiment. I detta experiment får eleverna isolera plasmid-DNA utan att använda giftiga kemikalier som fenol eller kloroform.

Supplier: EDVOTEK

Med hjälp av mikroarrayteknik kan forskarna screena ett stort antal prover i en och samma analys. Denna teknik möjliggör HTS (höghastighetsscreening) av små provvolymer samt jämförelser mellan frisk och sjuk vävnad. I detta experiment får studenterna screena för positiva och negativa prover genom att tillsätta simulerade DNA- och RNA-prover till ett membran.

Supplier: EDVOTEK

DNA från bakteriofag lambda är en välkaraktäriserad molekyl innehållande sex klyvningsställen för Eco RI (5 distinkta ställen, 2 är mycket nära varandra i storlek). I detta experiment klyvs lambda-DNA med Eco RI-endonukleas. Klyvningsprodukterna analyseras med agarosgelelektrofores.

Supplier: EDVOTEK

I det här experimentet lär sig studenterna om tillämpning av restriktionsenzymklyvning inom kriminaltekniken. Studenterna får klyva DNA med restriktionsenzymer och sedan jämföra bandmönstret för DNA från brottsplatsen med DNA från två misstänkta med hjälp av gelelektrofores.

Supplier: EDVOTEK

Fyra experimentmoduler kombineras i ett experiment i en utförlig bioteknisk undersökning som fokuserar på grönt fluorescerande protein (GFP). Bakteriecellerna transformeras så att de uttrycker GFP. De transformerade cellerna får växa till och GFP, t renas med kolonnkromatografi. Slutligen analyseras proteinfraktionerna med avseende på renhet med SDS-polyakrylamidelektrofores.

Supplier: EDVOTEK

När DNA subklonas i pUC-polylinkerregionen avbryts produktionen av β-galaktosidas, vilket medför att cellerna blir oförmögna att hydrolysera X-gal. Det leder till att vita kolonier produceras mot en bakgrund av blå kolonier. Det här experimentet innehåller ett DNA-fragment samt en linjär plasmid och T4-DNA-ligas. Efter ligeringen, som resulterar i den rekombinanta plasmiden, transformeras kompetenta E. coli-celler och antalet rekombinanta antibiotikaresistenta vita och blå kolonier fastställs. β-galaktosidasaktiviteten analyseras utifrån blå och vita bakterieceller.

Supplier: EDVOTEK

De tre oftast använda restriktionsenzymerna är Eco RI, Bam HI och Hind III. Varje enzym katalyserar klyvning vid en definierad bassekvens. Alla enzymer är frystorkade och innehåller 1 500 enheter. En enhet är den mängd enzym som krävs för klyvning av 1,0 µg lambda-DNA på 60 minuter vid 37 °C i en reaktionsblandning om totalt 50 µl.

Supplier: G-Biosciences

The kit utilises the principle of diffusion of nucleic acids on a nylon membrane to determine their concentration. No spectrophotometers required.

Supplier: G-Biosciences

In this lab activity, students learn to perform simple protein isolation procedures to isolate the protein fingerprint from various fresh tissues. They will compare the protein fingerprints of four different tissues to understand that the function of a particular organ is due to the proteins that are localised to the specific organ. Also included in this kit are four dried protein samples (from mouse liver, brain, heart and lungs) to compare as a control, if fresh tissues cannot be obtained.

Supplier: G-Biosciences

I denna laboration utför eleverna experiment för att ta fram proteinfragment genom användning av ett proteas och därefter analysera proteinfragmenten med elektrofores. Genom analys av proteinets fragmenteringsmönster, dvs. proteinfingeravtryck, lär sig eleverna om proteinsekvens, -struktur och deras konservering. Eleverna separerar en uppsättning med tre funktionellt identiska proteinprover som valts från djurriket, inbegripande människa, nöt och får. Efter att ha alstrat fingeravtryck genom elektrofores undersöker eleverna varje provs proteinfingeravtryck för att bestämma graden av konservering.

Supplier: G-Biosciences

Det slutliga målet inom molekylärbiologi är ofta uttryck av ett rekombinant protein. De transformerade plasmiderna kan användas som mallar av bakterierna för att producera protein. Eleverna lär sig om nödvändiga promotorer och andra beståndsdelar som är nödvändiga för ett framgångsrikt proteinuttryck i bakterier, inbegripande skillnaderna mellan inducerbart och konstitutivt (oreglerat) uttryck. Laborationen låter eleverna uttrycka ett protein antingen konstitutivt eller under kontroll av en inducerbar promoter, vilken aktiveras med IPTG (isopropyl-beta-D-tiogalaktopyranosid).

Supplier: G-Biosciences

Denna laboration inbegriper analys av en enzymreaktion med användning av ett specifikt enzymsubstrat och hämmare. Eleverna undersöker hur enzymreaktionens hastighet är beroende av substratets koncentration och inverkan av medel (hämmare) och förhållanden som påverkar enzymreaktionen, såsom pH och temperatur.

Supplier: G-Biosciences

Denna laboration har två mål - dels att fördjupa förståelsen av proteinmolekyler och dels att eleverna skall lära sig möjligheterna med elektrofores för proteinanalys. Eleverna undersöker de grundläggande principerna för proteinernas struktur, från deras primärstruktur till de mera komplexa tertiära och kvartära strukturerna, med hjälp av proteinelektrofores. Komplexa blandningar av proteinprover och karaktäriserade rena proteinprover används, i kombination med elektrofores, för att undersöka proteinstrukturen och möjligheterna med proteinelektrofores. Med användning av icke-denaturerande och denaturerande elektrofores förstår eleverna skillnaden mellan primära, tertiära och kvartära strukturer, betydelsen av disulfidbryggor för att bibehålla proteinets struktur och elektrofores vid undersökande av hela proteiner och proteinunderenheter.

Supplier: G-Biosciences

En stor utmaning för molekylärbiologer och gentekniker är att enkelt detektera och analysera genetiska mutationer som förekommer naturligt, orsakar sjukdomar, under genteknik eller kloning, oavsett om de är avsiktliga eller slumpmässiga. Eleverna lär sig om olika sorters genmutationer, inbegripande substitutioner, deletioner och punktmutationer och dessutom olika tekniker som används för att detektera genetiska mutationer. Satsen innehåller alla reagenser som behövs för att screena simulerade kliniska prover med avseende på en mutant gen, med användning av både polymeraskedjereaktionen (PCR) och kartläggning med restriktionsspjälkning. Eleverna utför ett enkelt kliniskt diagnostiskt försök för att identifiera en sjuk patient.

Supplier: G-Biosciences

Biodiversitetslaborationen är utformad för bestämning av proteinhalt och biomassa i olika biologiska prover detta för att undersöka hur biomassa förhåller sig till biodiversitet i naturen. Eleverna samlar in och katalogiserar prover av växtblad från en blandad grupp lokala växter. Denna laboration inbegriper bestämning av färskvikt för varje växtprov, att mala en förutbestämd mängd av varje prov och efterföljande extrahering av proteiner från respektive prov. Eleverna lär sig sedan att bestämma proteinhalten i varje växtprov och försöker relatera proteinhalten till biomassa. Eleverna utmanas i denna laboration att tänka, analysera och söka svar på varför proteinbiomassor varierar för en viss färskvikt från olika växter. Slutligen kommer de att relatera den slutsatsen till naturens biodiversitet.

Supplier: G-Biosciences

Med användning av proteinelektroforesexperiment kit kommer eleverna att lära sig principerna för olika sorters elektroforeser, inbegripande denaturerande och icke-denaturerande elektrofores, och hur denna kraftfulla teknik används för att analysera proteiner. Experimentet kommer att introducera eleverna för de olika separationsmatriser som används för proteinseperation. De kommer att förstå deras olika egenskaper och deras roll vid proteinanalys. Eleverna kan antingen gjuta sina egna polyakrylamidgeler eller använda sig av färdiggjutna kommersiellt tillgängliga geler. Dentt kit levereras med alla reagens, buffertar och tillbehör som behövs för att gjuta akrylamidgeler, bereda proteinprover, köra elektrofores och färga in gelerna för visualisering av proteinbanden. Testproteinprover och proteinstandarder medföljer också.

Supplier: G-Biosciences

Efter spjälkning av DNA med restriktionsenzym behöver forskarna åter föra samman ändarna av DNAt för att alstra rekombinant DNA, en process som kallas ligering. Ligering av DNA åstadkoms med det bakteriella enzymet T4 DNA-ligas, vilket katalyserar bildningen av fosfodiesterbindningar. DNA-ligeringssatsen lär eleverna om ligering när de ligerar samman flera DNA-fragment för att skapa större DNA-delar som lätt identifieras med agaroselektrofores.

Supplier: G-Biosciences

Bestämning av proteinhalten är en nödvändig teknik vid alla aspekter av proteinundersökningar och proteomik. Satsen med analyserna för proteinkvantifiering inbegriper tre av de mest använda proteinanalyserna och medger en direkt jämförelse av de tre analyserna som lär eleverna fördelarna och begränsningarna med varje analys. Varje analys finns tillgänglig separat för att medge undervisning om en särskild analys, utan alternativet att jämföra och kontrastera mot de övriga analyserna. De tre analyserna som ingår är Biurets proteinanalys, Lowrys proteinanalys och proteinanalys med färgmedlet Coomassie-blått. Satsen med analyser för proteinkvantifiering tillhandahåller alla reagens som krävs för att utföra båda proteinanalyserna, inbegripande proteinstandarder för noggrann kvantifiering, med en enda laboration. En faktor som ofta underskattas vid proteinkvantifiering är närvaron av störande ämnen som inte är proteiner, såsom salter och detergenter. Denna sats lär eleverna om vanliga laboratoriemedel som påverkar proteinanalyserna, tankegångarna bakom deras störningar och hur man undanröjer störningen. Eleverna lär sig även hur man väljer en proteinanalys för olika tillämpningar.