Microbial Amplicon Barcoding Kit 24 V14

Amplifikation und vollständige Sequenzierung von 16S rRNA für die bakterielle Profilierung und ITS für die Pilzprofilierung, mit Barcoding für bis zu 24 Proben.

• Ermöglicht die vollständige Sequenzierung von 16S rRNA (bakterielles Profiling) und ITS (Pilz-Profiling)
• Ermöglicht die Identifizierung von Bakterien auf Gattungsebene
• Bietet einen schnellen, kostengünstigen Arbeitsablauf – schneller als ligationsbasierte Ansätze
• Verwendet einen fragmentierungsfreien Prozess, der Amplikons in voller Länge bewahrt

Das mikrobielle Amplicon-Barcoding-Sequenzierungskit 24 V14 bietet eine Methode zur Amplifikation der gesamten 16S-rRNA oder des ITS-Gens aus extrahierter gDNA, gefolgt von der Bibliotheksvorbereitung. Dieses Kit enthält aktualisierte Primer, die eine vollständige Sequenzierung von 16S rRNA für die bakterielle Profilierung und ITS für die Pilzprofilierung aus verschiedenen Probentypen ermöglichen.

Bitte beachten: Diese Primerschemata entsprechen dem Industriestandard und decken das gesamte 16S-rRNA- bzw. ITS-rRNA-Gen ab. Allerdings binden die verwendeten Primer in Regionen, die nicht artenübergreifend zu 100 % konserviert sind, und daher kann eine Amplifikation für alle Arten nicht garantiert werden. Bitte stellen Sie sicher, dass Sie ein Kontrollexperiment durchführen, um festzustellen, ob die Zielspezies mit den in diesem Kit enthaltenen Primern amplifiziert werden.

Die DNA wird mittels PCR unter Verwendung spezifischer 16S- oder ITS-Primer amplifiziert. Anschließend werden bis zu 24 Amplikonproben mit einem Barcode versehen. Diese Barcodes enthalten 5'-Tags, die die ligasefreie Anbringung von Rapid-Sequencing-Adaptern erleichtern. Barcoding oder Multiplexing ist nützlich, wenn die pro Probe erforderliche Datenmenge geringer ist als die Gesamtdatenmenge, die aus einer einzelnen Durchflusszelle generiert werden kann: Es ermöglicht einem Benutzer, mehrere Proben zusammenzufassen und sie gemeinsam zu sequenzieren, wodurch die Durchflusszelle effizienter genutzt wird.

Dieses Kit verwendet die Chemie von Kit 14, die eine verbesserte Genauigkeit der modalen Rohlesesequenzierung mit hoher Leistung auf der neuesten Nanopore umfasst: R10.4.1. Die Priming- und Sequenzierungsreagenzien für die Durchflusszelle sind ebenfalls im Sequenzierungskit enthalten und mit dem R10.4.1-Nanopore kompatibel. Diese Chemie bietet eine höhere Erfassungsrate von gDNA, um geringere Durchflusszellenbeladungsmengen zu ermöglichen, und eine Brennstofffixierungstechnologie, die es Benutzern ermöglicht, längere Experimente durchzuführen, ohne dass während des Laufs Brennstoff hinzugefügt werden muss.

Das Kit wird durch den EPI2ME wf-16S-Workflow unterstützt, der zur Analyse von Daten aus dem Protokoll des mikrobiellen Amplicon-Barcoding-Sequenzierungskits 24 V14 (SQK-MAB114.24) verwendet werden kann. Die Dekonvolution von Barcode-Sequenzierungsdaten wird von Dorado und EPI2ME unterstützt, die die Barcode-Sequenz klassifizieren und die Lesevorgänge in entsprechende Ordner sortieren.

Die Probenmultiplexierung beträgt ≤24.

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